Couleurs dans R: Ressources Géniales que Vous Aimeriez Savoir

Palettes RColorBrewer

• Tout d’abord, chargez le package comme suit:

library("RColorBrewer")

• Utilisation dans le graphique de base:

barplot(c(2, 5, 8), col = brewer.pal(n = 3, name = "Dark2"))

• Utilisation dans ggplot:

ggplot(iris, aes(Species, Sepal.Length)) +
  geom_boxplot(aes(fill = Species)) +
  scale_fill_brewer(palette = "Dark2")

Plus d’informations ici : Palette de Couleurs RColorBrewer de A -à- Z

Palettes de couleurs Viridis

• Tout d’abord, chargez le package comme suit:

library("viridis")

• Utilisation dans les graphiques de base de R

barplot(c(2, 5, 8), col = viridis(3))

• Utilisation dans ggplot:

ggplot(iris, aes(Species, Sepal.Length)) +
  geom_boxplot(aes(fill = Species)) +
  scale_fill_viridis(discrete = TRUE)

Read more at: Palettes de couleurs Viridis

Palettes de couleurs pour revues scientifiques

Le package ggsci de R contient une collection de palettes de couleurs de haute qualité inspirées des couleurs utilisées dans les revues scientifiques, les packages de visualisation de données, etc. Par exemple:

• scale_color_npg() et scale_fill_npg() : Nature Publishing Group
• scale_color_aaas() et scale_fill_aaaas() : Association américaine pour l’avancement des sciences
• scale_color_lancet() et scale_fill_lancet() : Journal Lancet
• scale_color_jco() et scale_fill_jco() : Journal of Clinical Oncology

• Tout d’abord, chargez le package comme suit:

library("ggsci")

• Utilisation dans les graphiques de base de R

barplot(c(2, 5, 8), col = pal_jco()(3))

• Utilisation dans ggplot:

ggplot(iris, aes(Species, Sepal.Length)) +
  geom_boxplot(aes(fill = Species)) +
  scale_fill_jco()

Lire plus à : ggsci color palettes

Palettes de couleurs Wes Anderson

Le package R correspondant contient 16 palettes de couleurs des films de Wes Anderson. Les palettes de couleurs disponibles sont indiquées dans le tableau ci-dessous :

• Tout d’abord, chargez le package comme suit:

library("wesanderson")

• Utilisation dans les graphiques de base de R

barplot(c(2, 5, 8), col = wes_palette("GrandBudapest1", n = 3))

• Utilisation dans ggplot:

ggplot(iris, aes(Species, Sepal.Length)) +
  geom_boxplot(aes(fill = Species)) +
  scale_fill_manual(values = wes_palette("GrandBudapest1", n = 3))

Lire plus à : Palettes de couleurs Wes Anderson

Palettes de couleurs de base de R

Il y a 5 fonctions de base R qui peuvent être utilisées pour générer un vecteur de n couleurs contiguës : rainbow(n), heat.colors(n), terrain.colors(n), topo.colors(n), et cm.colors(n).

• Utilisation dans les graphiques de base de R:

barplot(1:5, col=rainbow(5))
# Utiliser de "heat.colors" (couleurs chaudes)
barplot(1:5, col=heat.colors(5))
# Utiliser les couleurs du terrain
barplot(1:5, col=terrain.colors(5))
# Utiliser "topo.colors"
barplot(1:5, col=topo.colors(5))
# Utiliser "cm.colors"
barplot(1:5, col=cm.colors(5))

• Utilisation dans ggplot:

ggplot(iris, aes(Species, Sepal.Length)) +
  geom_boxplot(aes(fill = Species)) +
  scale_fill_manual(values = rainbow(3))