9  Desarrollo de Paquetes R en VSCode

Palabras clave

Desarrollo de paquetes R, VSCode para paquetes R, Roxygen2 en VSCode, devtools para paquetes R

9.1 Introducción

El desarrollo de paquetes R es un aspecto clave para compartir código R reutilizable y mejorar sus habilidades de programación. Visual Studio Code (VSCode) proporciona un entorno optimizado que hace que el desarrollo de paquetes sea eficiente e intuitivo. Con las extensiones y configuraciones adecuadas, VSCode puede soportar todos los aspectos de la creación de paquetes R, desde la escritura de funciones hasta la documentación y las pruebas. En este capítulo, exploraremos cómo usar VSCode para desarrollar paquetes R.



9.2 Requisitos previos

  • Instale las herramientas esenciales para la programación de R en VSCode como se indica en los capítulos anteriores (Capítulo 2 y Capítulo 3).

  • Asegúrese de que tiene los paquetes devtools y roxygen2 instalados en R para el desarrollo de paquetes. Si no, instálelas con:

    install.packages("devtools")
install.packages("roxygen2")
Nota

Tenga en cuenta que devtools es un paquete de desarrollo que simplifica la creación, documentación y prueba de paquetes, mientras que roxygen2 se utiliza para documentar funciones.

9.3 Creación de un nuevo paquete de R

Siga estos pasos:

  1. Crear un directorio de paquetes: Utiliza la función create() de devtools para crear una nueva estructura de paquetes. Ejecute lo siguiente en un terminal R:

    devtools::create("path/to/your/package")

    Esta función creará un directorio con la estructura necesaria para un paquete R, incluyendo carpetas como R/ para las funciones y man/ para la documentación.

  2. Abrir el directorio en VSCode: En VSCode, haz click en File > Open Folder... y selecciona el directorio del paquete. Esto te permite editar los archivos de tu paquete, añadir funciones y escribir documentación.

9.4 Escribir funciones y documentación

Una vez que la estructura de tu paquete esté lista, puedes empezar a escribir funciones en la carpeta R/. VSCode hace este proceso eficiente con características como IntelliSense y linting.

  • Desarrollo de funciones: Cree un nuevo archivo .R en la carpeta R/. Escriba sus funciones como lo haría en cualquier script de R. El IntelliSense de VSCode le sugerirá nombres de funciones y argumentos, ayudándole a evitar errores.

  • Documentación con Roxygen2: Documenta tus funciones usando los comentarios de roxygen2. Añade comentarios que empiecen por#’encima de cada función para describir su propósito, parámetros y valores de retorno. Por ejemplo: ```r #' Calculate the Mean of a Vector #' #' This function calculates the arithmetic mean of a given numeric vector. #' #' @param x A numeric vector. #' @return The mean of the vector. #' @export calculate_mean <- function(x) { mean(x, na.rm = TRUE) } ``` Después de documentar, ejecutedevtools::document()para generar archivos.Rden la carpetaman/`.

9.5 Pruebe su paquete

Las pruebas son cruciales para garantizar que el paquete funciona como se espera. VSCode y R proporcionan herramientas para facilitar las pruebas unitarias:

  • Paquete Testthat: Utiliza el paquete testthat para escribir pruebas unitarias. Instálelo con:

    install.packages("testthat")

    Crea una carpeta tests/ en el directorio de tu paquete y añade archivos de prueba siguiendo la siguiente estructura:

    test_that("calculate_mean works correctly", {
  expect_equal(calculate_mean(c(1, 2, 3)), 2)
  expect_equal(calculate_mean(c(NA, 2, 3)), 2.5)
})

  • Ejecutar Pruebas: Ejecutar pruebas con devtools::test(). El terminal integrado de VSCode facilita la ejecución de comandos sin salir del editor.

9.6 Creación e instalación del paquete

Para compilar el paquete y crear un archivo comprimido (.tar.gz), ejecute:

devtools::build()

Este archivo puede ser compartido e instalado por otros utilizando install.packages("yourpackage.tar.gz", repos = NULL, type = "source").

Para instalar y probar tu paquete localmente:

devtools::install()

Este comando instalará tu paquete, haciéndolo disponible para su uso en tu sistema.

9.7 Depuración y resolución de problemas

VSCode proporciona varias características que facilitan la depuración de su paquete R:

  • Integración con el terminal R: Puedes probar funciones interactivamente en el terminal de R cargando tu paquete con devtools::load_all(). Esto carga el paquete en el entorno de R sin necesidad de reinstalarlo, lo que facilita la comprobación de los cambios.

  • Puntos de ruptura y depuración: Aunque las herramientas de depuración de VSCode no están tan integradas en R como en otros lenguajes, puedes utilizar las funciones de depuración nativas de R (browser(), trace(), etc.) para investigar problemas en tu código.

9.8 Control de versiones con Git

El uso de Git para el control de versiones es una parte esencial del desarrollo de software moderno. VSCode tiene soporte Git incorporado, permitiéndote:

  • Seguimiento de cambios: Monitoriza los cambios en los archivos de tu paquete R directamente desde la pestaña Source Control de VSCode.
  • Commit y Push: Confirme sus cambios y empújelos a un repositorio remoto (por ejemplo, GitHub) para colaboración o copia de seguridad.
  • Ramificación: Crear y cambiar entre ramas para trabajar en diferentes características o correcciones de forma independiente.

9.9 Ejemplo de Flujo de Trabajo de Desarrollo de Paquetes

  1. Crea la estructura del paquete: Utilice devtools::create() para generar una nueva carpeta de paquete.
  2. Escribir funciones: Añadir tus scripts R a la R/ directory and document them using roxygen2.
  3. Probar su código: Escriba pruebas unitarias utilizando testthat and store them in tests/testthat/.
  4. **Documentación y compilación Ejecuta devtools::document() para crear la documentación, y devtools::build() para construir el paquete.
  5. Instalar y probar localmente: Instale su paquete con devtools::install(), luego pruebe las funciones interactivamente.

Lee más sobre el desarrollo de paquetes R en la documentación oficial.

9.10 Conclusión

Desarrollar paquetes R en VSCode es una experiencia suave y gratificante con las herramientas adecuadas. Aprovechando extensiones como vscode-R y paquetes como devtools y roxygen2, puedes crear paquetes de R bien documentados y probados que son fáciles de compartir y mantener. El terminal integrado de VSCode, el control de versiones y las ricas características de edición lo convierten en un entorno excelente tanto para desarrolladores novatos como experimentados en R.

¿Preparado para profundizar en sus conocimientos de programación en R? En el siguiente capítulo, exploraremos el uso de Git para un control de versiones eficaz, asegurando que su código base se mantiene organizado y colaborativo.